7 июня 1990 года в Троице-Сергиевой лавре состоялся Поместный собор Русской православной церкви, ставший лишь пятым в истории РПЦ. На нем избрали нового Патриарха Московского и всея Руси, которым стал митрополит Ленинградский и Новгородский Алексий (Ридигер).
Собор был созван, прежде всего, в связи со смертью прежнего Патриарха Пимена. Кроме того, РПЦ к тому моменту столкнулась с рядом серьезных проблем, вызванных изменениями в стране. Так, на западе Украины активизировались униаты и раскольники. Кроме того, в стране свои структуры начала создавать Русская православная церковь за рубежом.
Поместный собор признал право униатов на создание собственных общин, но осудил насилие над православными клириками и мирянами, захваты православных храмов и выразил протест против действий властей Западной Украины по отношению к сторонникам РПЦ. Также священнослужители не поддержали создание структур РПЦ(з) в Советском Союзе, отметив, что это подрывает единство церкви.
Главным событием Поместного соборы стало избрание Патриарха. Выборы прошли по демократической схеме: архиереи выбрали трех кандидатов, затем 317 делегатов поместного собора избрали из них патриарха.
По итогам первого тура митрополит Алексий получил 139 голосов, митрополит Ростовский и Новочеркасский Владимир (Сабодан), будущий Митрополит Киевский и всея Украины – 107, местоблюститель Патриаршего престола митрополит Киевский и Галицкий Филарет (Денисенко), впоследствии перешедший на сторону раскольников и преданный анафеме – 66. Во втором туре Алексий, набравший 166 голосов, обошёл Владимира на 23 голоса и был избран Патриархом.
Нынешний Патриарх Московский и всея Руси Кирилл позже отмечал: «мне довелось участвовать не только в работе Поместного Собора, но и в его подготовке. Конечно, тогдашние труды были напряжёнными, но радостное ощущение, что многое в жизни Церкви и общества меняется к лучшему, наверное, преобладало. Было и чувство огромной ответственности за будущее Церкви».